Το πόσιμο νερό μπορεί να μολυνθεί από βακτήρια, ιούς, βαρέα μέταλλα, υπολείμματα φυτοφαρμάκων και χημικούς ρυπαντές. Τα νερά που προορίζονται για ανθρώπινη κατανάλωση, επιβάλλεται να πληρούν συγκεκριμένα πρότυπα ποιότητας και κανονισμούς για την προστασία της δημόσιας υγείας.
Η ποιότητα του νερού αξιολογείται με τον προσδιορισμό διαφόρων παραμέτρων, όπως, μικροβιολογικές παράμετροι, φυσικοχημικές, μέταλλα, υπολείμματα φυτοφαρμάκων και άλλες ουσίες που μπορεί να βρεθούν στο νερό και να το μολύνουν. Έχουν ορισθεί από τη νομοθεσία οι παραμετρικές τιμές, δηλαδή, η μέγιστη τιμή που πρέπει να έχει η κάθε παράμετρος, για να χαρακτηρισθεί ένα νερό πόσιμο.
Η μικροβιολογική ανάλυση του πόσιμου νερού περιλαμβάνει τον έλεγχο των παραμέτρων Escherichia coli και Εντερόκοκκων. Για την αξιολόγηση της ποιότητας του νερού εμφιάλωσης, εξετάζονται επιπλεόν οι παράμετροι: Pseudomonas aeruginosa, ο αριθμός των αποικιών σε 22 C και ο αριθμός των αποικιών ε 37 C.